深圳國際物流系統是由產品的包裝、存儲、裝運、檢驗、流通加工和其前前后后的分類整理、再包裝及其國際配送等子系統構成。這其中，存儲和裝運子系統是物流貨運的兩大支柱。深圳國際物流公司根據產品的存儲和裝運，完成其本身的時間和空間效益，很大程度地符合國際貿易活動和跨國公司經營的要求。
1、裝運子系統
國際貨物運輸是深圳國際物流公司系統的關鍵。產品根據國際貨物運輸作業由賣方轉移給買方。國際貨物運輸具備路線長、階段多、覆蓋面廣、辦理手續復雜、風險性大、時效性強等顯著特點。運輸成本在國際貿易產品價格中占據很大比例。國際運輸主要包含運輸方式的選擇、裝運單據的解決及其投保等相關方面。
2、倉儲子系統
產品存儲、存放使產品在其流通過程中處在一種或長或短的相對停滯的狀態，這類停滯是完全必要的。這是因為，商品流通是一個由分散到集中，再由集中到分散的持續不斷的流通過程。國際貿易和跨國經營中的產品從生產廠家或供應部門被集中裝運到裝運港口，有時須臨時地存放一段時間，再出口貿易，是一個集和散的過程。
3、商品檢驗子系統
因為國際貿易和跨國經營具備投資大、風險性高、周期時間較長等顯著特點，促使商品檢驗成為深圳國際物流公司體系中至關重要的子系統。根據商品檢驗，確定交貨產品質量、數量和包裝條件是否符合合同規定。如發現問題，可分清責任，向相關層面索要賠償。在買賣協議中，通常都標注有商品檢驗條文。
4、商品包裝子系統
產品的注冊商標和包裝代表著企業的面孔，它體現了一個國家的綜合科技文化水平。為提升商品包裝體系的功能和效率，應提升廣大外貿職工對出口貿易商品包裝工作必要性的了解，塑造現代包裝意識和包裝觀念；盡快創建起一大批出口貿易商品包裝工業基地，以滿足外貿發展的需求，符合國際市場、國際物流公司系統對出口貿易商品包裝的各種各樣的特殊要求；仔細安排好多樣化的包裝物料和包裝材料的供應工作。
5、國際物流信息子系統
主要功能是收集、處理和傳送國際物流公司和商流的信息情報信息。國際物流信息系統的顯著特點是信息量大，互換頻繁；傳送量大，時效性強；階段多，點多，線長。深圳物流國際公司已創建了技術優秀的國際物流信息系統。
